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各話標題
| 話數 | 標題 | 播出日期 |
|---|---|---|
| 1 | 完成！ニンジャガム！ | 2022-01-08 |
| 2 | バートンとベレッカの長い一日 | 2022-01-15 |
| 3 | 目覚めよ！少年バーン！ | 2022-01-22 |
| 4 | 秘密の瞳のルーシー | 2022-01-29 |
| 5 | ニンジャダンサー・エマ | 2022-02-05 |
| 6 | WNAアカデミー！バトルスタート！ | 2022-02-12 |
| 7 | シノビの里のカッペイ | 2022-02-19 |
| 8 | 決死の潜入！WNA本部！ | 2022-02-26 |
| 9 | エマとルーシー 小さな冒険 | 2022-03-05 |
| 10 | 新たな仲間？ロンとジェーン | 2022-03-12 |
| 11 | 地獄のサバイバルミッション | 2022-03-19 |
| 12 | かくれんぼで未知との遭遇 | 2022-03-26 |
| 13 | ニンジャ捕獲中 | 2022-04-02 |
| 14 | バートンを尾行せよ | 2022-04-09 |
| 15 | その名はスペースニンジャ！ | 2022-04-16 |
| 16 | シノビの務め | 2022-04-23 |
| 17 | ロンとジェーンの潜入ミッション | 2022-04-30 |
| 18 | 夕陽に向かって帰れ | 2022-05-07 |
| 19 | オランジイのなく海 | 2022-05-14 |
| 20 | 逃亡者レナード | 2022-05-21 |
| 21 | オエド温泉物語 | 2022-05-28 |
| 22 | バートンとチョコミン | 2022-06-04 |
| 23 | イーグルシティ夏の陣 | 2022-06-11 |
| 24 | カゲとの戦い | 2022-06-18 |
| 25 | オエドニンジャ大作戦！前編 | 2022-06-25 |
| 26 | オエドニンジャ大作戦！後編 | 2022-07-02 |
| 27 | 開催！ニンジャラCS | 2022-07-09 |
| 28 | バートンVSベレッカ！ | 2022-07-16 |
| 29 | 美食ニンジャ・キース見参 | 2022-07-23 |
| 30 | ダンとタイラー | 2022-07-30 |
| 31 | 行けカッペイ！新巻鮭！ | 2022-08-06 |
| 32 | バーン！燃やせニンジャ魂！ | 2022-08-13 |
| 33 | ルーシー改造計画 | 2022-08-20 |
| 34 | サバイバルバトル決勝戦！ | 2022-08-27 |
| 35 | 決定！ニンジャラマスター！ | 2022-09-03 |
| 36 | ビーチでニンジャが休息 | 2022-09-10 |
| 37 | オエドタウン・ぶらり旅 | 2022-09-17 |
| 38 | 恐怖！アカデミーの夜 | 2022-09-24 |
| 39 | オイラは剣士カッペイ | 2022-10-01 |
| 40 | やれいけ！パンプキン大魔王 | 2022-10-08 |
| 41 | 振り向けばロンがいる | 2022-10-15 |
| 42 | 清き一票！仁義なき選挙戦 | 2022-10-22 |
| 43 | 追放!?ＷＮＡアカデミー | 2022-10-29 |
| 44 | うんち諸君！ | 2022-11-05 |
| 45 | 風雲‼アジト攻略戦 | 2022-11-12 |
| 46 | イーグルシティの新英雄（ニューヒーロー） 前編 | 2022-11-19 |
| 47 | イーグルシティの新英雄（ニューヒーロー） 後編 | 2022-11-26 |
| 48 | 執念の暗殺者 | 2022-12-03 |
| 49 | 隕石大争奪バトル！ | 2022-12-10 |
| 50 | シャドーニンジャの逆襲 | 2022-12-17 |
| 51 | オペラ座の決戦！ | 2022-12-24 |
| 52 | 究極奥義・無明闇分身 | 2023-01-07 |
| 53 | ＷＮＡ解体命令!? | 2023-01-14 |
| 54 | 断崖（がけ）の上のルーシー | 2023-02-04 |
| 55 | 我が名はマスターシャドー | 2023-02-11 |
| 56 | ギブミー！ニンジャガム！ | 2023-02-18 |
| 57 | アカデミー攻防戦！ | 2023-02-25 |
| 58 | イーグルシティ独立宣言 | 2023-03-04 |
| 59 | 決闘！バートンVSダン | 2023-03-11 |
| 60 | 衝撃！仮面の下の真実 | 2023-03-18 |
| 61 | 急襲！ボトルコレクターズ | 2023-03-25 |
| 62 | WNA！史上最大の忍務！ | 2023-04-01 |
| 63 | 鬼神招来！目覚めよバートン | 2023-04-08 |
| 64 | イーグルシティの来訪者 | 2023-04-15 |
| 65 | どーするオレ⁉どーするエゼット！ | 2023-04-22 |
| 66 | 開幕！ニンジャラBF（バトルフェスティバル） | 2023-04-29 |
| 67 | 参上！怪盗エゼット | 2023-05-06 |
| 68 | バーンのリーダーはつらいよ | 2023-05-13 |
| 69 | 狙われたロン | 2023-05-20 |
| 70 | 狙われたロン | 2023-05-27 |
| 71 | 宇宙から来た二人組 | 2023-06-03 |
| 72 | 仲間を信じて勝利をつかめ！ | 2023-06-10 |
| 73 | エゼットの使命 | 2023-06-17 |
| 74 | さらわれたベレッカ！ | 2023-06-24 |
| 75 | ようこそ！WNAアカデミー | 2023-07-01 |
| 76 | 宇宙船復活大作戦 | 2023-07-08 |
| 77 | 宇宙を目指してフィッシング！ | 2023-07-15 |
| 78 | 11人…いる!? | 2023-07-22 |
| 79 | 猫とカラスと源柳斎と | 2023-07-29 |
| 80 | フンドルケットル危機一髪 | 2023-08-05 |
| 81 | はるばる来たぜメルウス星 | 2023-08-12 |
| 82 | 初忍務はグルメ偵察 | 2023-08-19 |
| 83 | オアシスを奪還せよ | 2023-08-26 |
| 84 | 遺跡の秘密は夜ひらく | 2023-09-02 |
| 85 | 激闘！目指せ大聖堂 | 2023-09-09 |
| 86 | 襲撃！ガムゴゼン | 2023-09-16 |
| 87 | メルウス星を取り戻せ！ | 2023-09-23 |
| 88 | 仁義なき選挙戦 パート２ | 2023-09-30 |
| 89 | 無人島でトレジャーハント | 2023-10-07 |
| 90 | ニンジャちがって、ニンジャいい | 2023-10-14 |
| 91 | 走れカッペイ！消えた源雲斎 | 2023-10-21 |
| 92 | ルーシーと熊ちゃんギャング団 | 2023-10-28 |
| 93 | 女スパイ ジェーンの秘密 | 2023-11-04 |
| 94 | ガムッチとの遭遇 | 2023-11-11 |
| 95 | ウォーレンの憂鬱 | 2023-11-18 |
| 96 | 発明家バートン | 2023-11-25 |
| 97 | 風林火山！アカデミー大運動会 | 2023-12-02 |
| 98 | 名探偵ベレッカの事件簿 | 2023-12-09 |
| 99 | さよなら？デイジー先生 | 2023-12-16 |
| 100 | カッペイ、ワニを届ける | 2023-12-23 |
| 101 | わがまま王女をエスコート | 2024-01-20 |
| 102 | オレがアタイでオイラがミーで | 2024-01-27 |
| 103 | バーンと夜明けのマーメイド | 2024-02-03 |
| 104 | ニンジャ動画をバズらせろ！ | 2024-02-10 |
| 105 | ゴローの長い一日 | 2024-02-17 |
| 106 | ルーシーのふたりはともだち | 2024-02-24 |
| 107 | 復讐のスカルニンジャ | 2024-03-02 |
| 108 | キースの孤独なグルメ？ | 2024-03-09 |
| 109 | 未来からの使者 | 2024-03-16 |
| 110 | タイラーと親父の畑 | 2024-03-23 |
| 111 | カモンベイビーアカデミー | 2024-03-30 |
| 112 | シノビの里の千年杉 | 2024-04-06 |
| 113 | 時をかける少年少女！？ | 2024-04-13 |
| 114 | 米騒動だ！韋駄天の伴二！ | 2024-04-20 |
| 115 | 河童襲来！千里眼のお絵馬 | 2024-04-27 |
| 116 | 大あばれ！千人力のおる卯 | 2024-05-04 |
| 117 | 夜にともる命の灯火 | 2024-05-11 |
| 118 | 鎌鼬が斬る！くノ一の慈艶 | 2024-05-18 |
| 119 | 烈火の吉平！妖かしの館 | 2024-05-25 |
| 120 | 侍修行！ コザルに弟子入り？ | 2024-06-01 |
| 121 | 底なし沼の白蛇伝説 | 2024-06-08 |
| 122 | 切捨御免？一反木綿！ | 2024-06-15 |
| 123 | 一寸お絵馬と打出の小槌 | 2024-06-22 |
| 124 | 戦国のニンジャラバトル！？ | 2024-06-29 |
| 125 | 食堂より愛をこめて | 2024-07-06 |
| 126 | 追撃！ガムニュウドウ | 2024-07-13 |
| 127 | ガムッチを探せ！ | 2024-07-20 |
| 128 | から傘三兄弟！ガムッチ救出作戦！ | 2024-07-27 |
| 129 | 戦場の論三郎 | 2024-08-03 |
| 130 | 響け雷鳴！千年杉の決戦 | 2024-08-10 |
| 131 | 湯けむり合戦（かっせん）！オエド猿軍団 | 2024-08-17 |
| 132 | 恋文は突然に！？どーするエゼット！ | 2024-08-24 |
| 133 | 忍者修行？ダンはグッジョブ！ | 2024-08-31 |
| 134 | 解散危機！？ボトルコレクターズ | 2024-09-07 |
| 135 | キースの宝物 | 2024-09-14 |
| 136 | ナオミ故郷に帰る | 2024-09-21 |
| 137 | 自分以外、全員敵！？ | 2024-09-28 |
| 138 | ガムッチ！ヌイグルミッチ！？ | 2024-10-05 |
| 139 | ニンジャ・オブ・ザ・デッド | 2024-10-12 |
| 140 | 打倒バートン！発明王は私よ！ | 2024-10-19 |
| 141 | 花火が開く夜空に | 2024-10-26 |
| 142 | バーンと謎の古文書 | 2024-11-02 |
| 143 | イーグルシティに雪が積もれば | 2024-11-09 |
| 144 | ブルースは笑わない | 2024-11-16 |