以《Fate/stay night》PC遊戲第三條主線故事改編而成的電影動畫,並分為三個章節「預示之花」、「迷途之蝶」和「春櫻之歌」。
士郎的身邊,有著仰慕他的少女——間桐櫻。她每天早晚都去士郎家裡做早餐晚餐,與無依無靠的士郎一同度過溫和的日子。但隨著「聖杯戰爭」的開始,流過冬木市的空氣發生了變化。各地發生殺人事件,不祥的空氣開始流動。士郎決定讓櫻留在自宅。士郎與召喚來的從者.Saber 一同,和魔術師遠坂凜締結同盟,面對「聖杯戰爭」。但這場戰爭卻由於暗中活躍的人們而發生巨大的錯位,開始產生歪曲。